Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms