Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gja6Q6S5G4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja6Q6S5G4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms