Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bnip1Q6QD59 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bnip1Q6QD59 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bnip1Q6QD59 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms