Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc57Q6PHN1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc57Q6PHN1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms