Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc82Q6PG04 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc82Q6PG04 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms