Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup98Q6PFD9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup98Q6PFD9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup98Q6PFD9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms