Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms