Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2lQ6PDS0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2lQ6PDS0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms