Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms