Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Herc4Q6PAV2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Herc4Q6PAV2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herc4Q6PAV2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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