Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cyp2d40Q6P8N9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms