Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc148Q6P5U8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc148Q6P5U8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc148Q6P5U8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms