Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg2aQ6P4T0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg2aQ6P4T0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms