Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sik3Q6P4S6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sik3Q6P4S6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms