Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Podnl1Q6P3Y9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Podnl1Q6P3Y9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Podnl1Q6P3Y9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Podnl1Q6P3Y9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Podnl1Q6P3Y9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Podnl1Q6P3Y9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Podnl1Q6P3Y9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Podnl1Q6P3Y9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms