Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frg2f1Q6P3A2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frg2f1Q6P3A2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frg2f1Q6P3A2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frg2f1Q6P3A2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Frg2f1Q6P3A2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Frg2f1Q6P3A2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Frg2f1Q6P3A2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Frg2f1Q6P3A2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Frg2f1Q6P3A2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Frg2f1Q6P3A2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Frg2f1Q6P3A2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Frg2f1Q6P3A2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Frg2f1Q6P3A2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frg2f1Q6P3A2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.9 ms