Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kdm2bQ6P1G2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm2bQ6P1G2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms