Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rad17Q6NXW6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rad17Q6NXW6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rad17Q6NXW6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad17Q6NXW6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad17Q6NXW6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad17Q6NXW6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad17Q6NXW6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad17Q6NXW6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad17Q6NXW6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad17Q6NXW6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad17Q6NXW6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad17Q6NXW6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad17Q6NXW6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms