Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SphkapQ6NSW3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SphkapQ6NSW3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms