Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
2810408A11RikQ6NSU2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms