Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ltv1Q6NSQ7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ltv1Q6NSQ7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms