Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt87Q6IMF0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt87Q6IMF0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms