Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt39Q6IFX4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt39Q6IFX4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms