Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms