Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nckap5lQ6GQX2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nckap5lQ6GQX2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nckap5lQ6GQX2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nckap5lQ6GQX2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Nckap5lQ6GQX2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nckap5lQ6GQX2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nckap5lQ6GQX2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nckap5lQ6GQX2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nckap5lQ6GQX2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nckap5lQ6GQX2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nckap5lQ6GQX2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Nckap5lQ6GQX2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nckap5lQ6GQX2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nckap5lQ6GQX2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nckap5lQ6GQX2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nckap5lQ6GQX2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nckap5lQ6GQX2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nckap5lQ6GQX2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms