Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg9bQ6EBV9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms