Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Smarca2Q6DIC0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Smarca2Q6DIC0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Smarca2Q6DIC0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms