Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx11Q6AXC6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms