Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2cQ69ZS6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2cQ69ZS6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2cQ69ZS6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2cQ69ZS6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2cQ69ZS6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2cQ69ZS6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2cQ69ZS6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2cQ69ZS6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2cQ69ZS6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2cQ69ZS6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2cQ69ZS6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2cQ69ZS6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2cQ69ZS6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2cQ69ZS6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2cQ69ZS6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2cQ69ZS6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2cQ69ZS6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sv2cQ69ZS6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2cQ69ZS6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms