Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Jmjd1cQ69ZK6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms