Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Msl2Q69ZF8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Msl2Q69ZF8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msl2Q69ZF8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msl2Q69ZF8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Msl2Q69ZF8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Msl2Q69ZF8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msl2Q69ZF8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msl2Q69ZF8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msl2Q69ZF8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msl2Q69ZF8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msl2Q69ZF8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msl2Q69ZF8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msl2Q69ZF8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msl2Q69ZF8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msl2Q69ZF8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Msl2Q69ZF8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msl2Q69ZF8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms