Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrcc1Q69ZB0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lrrcc1Q69ZB0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms