Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3ipQ68EF0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms