Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrc8eQ66JT1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc8eQ66JT1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms