Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VclQ64727 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VclQ64727 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VclQ64727 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VclQ64727 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VclQ64727 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VclQ64727 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VclQ64727 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VclQ64727 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VclQ64727 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VclQ64727 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VclQ64727 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VclQ64727 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VclQ64727 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VclQ64727 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VclQ64727 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VclQ64727 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VclQ64727 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VclQ64727 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VclQ64727 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VclQ64727 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VclQ64727 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VclQ64727 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VclQ64727 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VclQ64727 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VclQ64727 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VclQ64727 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VclQ64727 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VclQ64727 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VclQ64727 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VclQ64727 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VclQ64727 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VclQ64727 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VclQ64727 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VclQ64727 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VclQ64727 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VclQ64727 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VclQ64727 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VclQ64727 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VclQ64727 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VclQ64727 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VclQ64727 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VclQ64727 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VclQ64727 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VclQ64727 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VclQ64727 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VclQ64727 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VclQ64727 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VclQ64727 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VclQ64727 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VclQ64727 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VclQ64727 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VclQ64727 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VclQ64727 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VclQ64727 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VclQ64727 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VclQ64727 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VclQ64727 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VclQ64727 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VclQ64727 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VclQ64727 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VclQ64727 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VclQ64727 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VclQ64727 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VclQ64727 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VclQ64727 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VclQ64727 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VclQ64727 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VclQ64727 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VclQ64727 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VclQ64727 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VclQ64727 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VclQ64727 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VclQ64727 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VclQ64727 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VclQ64727 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VclQ64727 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VclQ64727 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VclQ64727 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VclQ64727 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VclQ64727 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VclQ64727 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VclQ64727 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VclQ64727 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VclQ64727 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VclQ64727 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VclQ64727 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VclQ64727 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VclQ64727 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VclQ64727 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VclQ64727 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VclQ64727 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VclQ64727 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VclQ64727 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VclQ64727 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VclQ64727 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VclQ64727 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VclQ64727 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VclQ64727 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VclQ64727 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms