Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Top2bQ64511 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Top2bQ64511 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms