Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn4Q62472 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lcn4Q62472 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lcn4Q62472 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms