Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3gl2Q62420 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3gl2Q62420 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3gl2Q62420 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3gl2Q62420 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3gl2Q62420 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3gl2Q62420 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3gl2Q62420 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3gl2Q62420 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3gl2Q62420 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3gl2Q62420 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Sh3gl2Q62420 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Sh3gl2Q62420 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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Sh3gl2Q62420 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3gl2Q62420 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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Sh3gl2Q62420 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3gl2Q62420 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3gl2Q62420 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3gl2Q62420 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3gl2Q62420 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3gl2Q62420 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3gl2Q62420 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3gl2Q62420 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3gl2Q62420 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3gl2Q62420 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
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Sh3gl2Q62420 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Sh3gl2Q62420 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Sh3gl2Q62420 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Sh3gl2Q62420 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Sh3gl2Q62420 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Sh3gl2Q62420 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3gl2Q62420 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms