Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl12Q62401 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms