Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim27Q62158 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim27Q62158 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim27Q62158 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms