Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sin3bQ62141 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms