Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctr9Q62018 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms