Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AlcamQ61490 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AlcamQ61490 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AlcamQ61490 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlcamQ61490 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms