Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msi1Q61474 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms