Protein–RNA interactions for Protein: Q61450

Gp49a, Mast cell surface glycoprotein Gp49A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp49aQ61450 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp49aQ61450 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp49aQ61450 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms