Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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