Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nell2Q61220 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nell2Q61220 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nell2Q61220 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nell2Q61220 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms