Protein–RNA interactions for Protein: Q61206

Pafah1b2, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b2Q61206 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pafah1b2Q61206 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms