Protein–RNA interactions for Protein: Q61037

Tsc2, Tuberin, mousemouse

Predictions only

Length 1,814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc2Q61037 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tsc2Q61037 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tsc2Q61037 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms