Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klf3Q60980 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms